医院院徽由“红十字”、绿色“心”形、阿拉伯数字“3”和中国传统纹样“祥云”等元素组成。以热情的红和生命的绿作为标识，彰显了医院坚持人民至上、生命至上的健康理念，体现了医院对生命医学的执着探索，表达了广大医务工作者对人民健康的美好愿景。

“红十字”为医疗卫生机构的标识。阿拉伯数字“3”代表第三附属医院。绿色的“心”形，代表健康、生命，寓意广大医务工作者用心呵护人民健康的决心和信心。“祥云”纹样为中国传统纹样，形似针推之回春妙手，代表医院的针灸推拿特色，寓意对人民群众健康的美好祝福和人民健康生活的美好向往。